Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms