Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms