Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms