Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
A0A1W2PPQ1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms