Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRQQ9UMZ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRQQ9UMZ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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