Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms