Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB23Q9ULC3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB23Q9ULC3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms