Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRXN1Q9ULB1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms