Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms