Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.55■■■□□ 2
REREQ9P2R6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
REREQ9P2R6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REREQ9P2R6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms