Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms