Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NYXQ9GZU5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NYXQ9GZU5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms