Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSDMCQ9BYG8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms