Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLVAPQ9BX97 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms