Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2Q9BX26 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms