Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR3CQ9BUI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms