Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT17Q9BSW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT17Q9BSW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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