Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEC22CQ9BRL7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms