Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEIS3Q99687 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms