Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALS2CR12Q96Q35 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms