Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JSRP1Q96MG2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JSRP1Q96MG2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms