Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCANQ96GW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms