Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP4Q969X6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms