Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113Q902F9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113Q902F9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms