Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD1Q8TEB9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD1Q8TEB9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms