Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms