Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC21AQ8NDW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC21AQ8NDW8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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