Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00116Q8NCU8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00116Q8NCU8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms