Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC63Q8NA47 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms