Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AMER3Q8N944 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMER3Q8N944 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms