Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms