Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTF1AQ7RTS3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms