Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC25A47Q6Q0C1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms