Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms