Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCSAPQ6IQ19 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCSAPQ6IQ19 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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