Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL2Q6F5E8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms