Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CARMIL1Q5VZK9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CARMIL1Q5VZK9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms