Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms