Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RSPH4AQ5TD94 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RSPH4AQ5TD94 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms