Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHSL1Q5SYE7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms