Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms