Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP28Q4G0W2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP28Q4G0W2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms