Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP20-2Q3LI61 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms