Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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