Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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ECM1Q16610 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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