Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIK5Q16478 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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