Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCN9AQ15858 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
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