Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTF1Q15361 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTF1Q15361 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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