Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NR1D2Q14995 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms