Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMCO1Q147U7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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